Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-ObO35424 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms