Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms