Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms