Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms