Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc16a8O35308 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 483 ms