Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2O35245 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms