Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ptpn9O35239 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ptpn9O35239 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ptpn9O35239 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ptpn9O35239 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ptpn9O35239 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ptpn9O35239 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ptpn9O35239 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ptpn9O35239 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Ptpn9O35239 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn9O35239 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms