Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CenpaO35216 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpaO35216 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms