Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe40O35185 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms