Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad6O35182 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms