Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcns1O35173 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms