Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alx4O35137 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms