Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1aO35134 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms