Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnih2O35089 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnih2O35089 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnih2O35089 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnih2O35089 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cnih2O35089 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cnih2O35089 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cnih2O35089 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih2O35089 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cnih2O35089 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cnih2O35089 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cnih2O35089 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih2O35089 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cnih2O35089 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih2O35089 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih2O35089 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cnih2O35089 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cnih2O35089 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih2O35089 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih2O35089 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih2O35089 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih2O35089 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih2O35089 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih2O35089 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih2O35089 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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