Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcm2O09102 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcm2O09102 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms