Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms