Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms