Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms