Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm5294J3QP53 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms