Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms