Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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E030018B13RikJ3QMS9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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E030018B13RikJ3QMS9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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E030018B13RikJ3QMS9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E030018B13RikJ3QMS9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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E030018B13RikJ3QMS9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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E030018B13RikJ3QMS9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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E030018B13RikJ3QMS9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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E030018B13RikJ3QMS9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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E030018B13RikJ3QMS9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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E030018B13RikJ3QMS9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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E030018B13RikJ3QMS9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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E030018B13RikJ3QMS9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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E030018B13RikJ3QMS9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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E030018B13RikJ3QMS9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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E030018B13RikJ3QMS9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E030018B13RikJ3QMS9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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