Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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