Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem200cJ3QK46 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms