Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
7530416G11RikJ3QJX6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms