Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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