Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pot1bH7BX60 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms