Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfip1G5E8V9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms