Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp6G5E8P0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms