Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcf11G3X9Z4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms