Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms