Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nccrp1G3X9C2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms