Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl26F8VQM2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms