Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcdh9F8VPK8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcdh9F8VPK8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms