Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28048F7BCN0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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