Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Crocc2F6XLV1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms