Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf212F6TQD1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf212F6TQD1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf212F6TQD1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf212F6TQD1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms