Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms