Protein–RNA interactions for Protein: E9QAB6

Ptar1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptar1E9QAB6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptar1E9QAB6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptar1E9QAB6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms