Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccdc7bE9Q9Y3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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