Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms