Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Simc1E9Q6E9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms