Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf11E9Q6E5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms