Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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