Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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