Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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