Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp558E9Q1J0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp558E9Q1J0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp558E9Q1J0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp558E9Q1J0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp558E9Q1J0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp558E9Q1J0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp558E9Q1J0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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