Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt78E9Q0F0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms