Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3095E9Q058 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms