Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Scaf11E9PZM7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms