Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms